В 2000 году в Красноярске было предотвращено 243 случая заболевания гепатитом В среди детей. Стоимость лечения одного случая составляет 30 тысяч рублей, или 7 млн. 290 тыс. руб. средств городского бюджета. На вакцинацию же было израсходовано 5 млн 234 тыс. руб.; таким образом, экономический эффект от программы только в 2000 году составил 2 млн 55 тыс. рублей. Что касается заболеваемости клещевым энцефалитом, то в 2001 году численность клещей на контрольных участках достигла 150 особей на квадратный метр, однако вспышки заболеваемости клещевым энцефалитом среди детей не наблюдалось.
На реализацию программы в 2002 году управлению необходимо 8,5 млн рублей. За счет этих средств будут прививаться дети до 14 лет и медицинские работники. За два года было поставлено более 35 тысяч прививок, заболеваемость же в привитых возрастных группах снизилась в 2,4 раза.