Преступление было совершено в сауне, которая расположена на территории Новосибирской государственной академии водного транспорта. В сауне должно Сергей Филатов должен был встретиться, по данным, озвученным Новосибирской телекомпанией НТН-4, «с друзьями – новосибирскими чиновниками и коллегами-депутатами или с сотрудниками предприятия „СИБИАР“». Сергей Филатов прибыл в сауну в 18.45, а в 19 часов его уже нашли мертвым. На месте обнаружена гильза 9-го калибра от пистолета Макарова (предположительно).
Прокуратурой Центрального района города Новосибирска возбуждено уголовное дело по статье «Умышленное убийство». В интервью новосибирским СМИ прокурор Центрального района города Новосибирска Юрий Кондратьев назвал в качестве возможных версий убийства, которые рассматривают следственные органы, депутатскую и предпринимательскую стороны деятельности погибшего. Ранее предполагалось, что Сергей Филатов на декабрьских выборах может стать кандидатом на место депутата Госдумы по Заводскому округу Новосибирска.
Глава администрации Новосибирской области Виктор Толоконский, напротив, выразил сомнение в том, что преступление будет раскрыто: «К сожалению, заказные преступления не расследуются в мире, в России и у нас, что порождает некоторое ощущение безнаказанности и незащищенности». В ходе экстренных оперативных действий убийцы задержаны не были, но, по словам главы администрации Новосибирской области Виктора Толоконского, для их поимки задействованы тысячи сотрудников правоохранительных органов как Центрального района, так и города и области. НТН-4 озвучила информацию, по которой персонал НГАВТ видел незнакомого человека на лестнице здания. Чтобы попасть в сауну, нужно пройти через вахтенный контроль, так что есть вероятность того, что внешность преступника может быть установлена. Как сообщают «Известия», «следствие заявило, что установило подозреваемых в деле об убийстве».
Для справки: предприятие «СИБИАР» функционирует с 1975 года как комплексное технологическое производство аэрозольной продукции. На заводе организован выпуск как товаров хозяйственно-бытового назначения, так и парфюмерии и косметики. В частности предприятие производит чистящие средства, антистатики, инсектициды, репелленты, автокосметику, освежители воздуха, средства для бритья и лаки для волос. В год завод выпускает свыше 40 миллионов аэрозольных баллонов, ассортимент представлен более чем 50 наименованиями. В 2001 «СИБИАР» перешло на углеводородную смесь пропан-бутана, используемую в качестве препеллента; приблизило вид и качество аэрозольных баллонов к европейскому уровню. Кроме торговли перечисленной продукцией, предприятие реализует фирмам, занимающимся наполнением баллонов, пустой аэрозольный баллон с клапаном.