Суммарное количество грузов, перевезенных компанией за прошлый год, составляет 11,7 млн тонн, в том числе 7 млн тонн апатитового концентрата, 4,3 млн тонн минеральных удобрений и 400 тыс. тонн прочих грузов.
За отчетный период была осуществлена обработка (погрузка-разгрузка) 175870 вагонов, 76% из которых находятся в аренде или собственности компании, а 24% принадлежат ОАО «РЖД».
Чтобы обеспечить перевозки, в 2005 года компания эксплуатировала 3208 вагонов (аренда и собственность), а также вагоны других собственников и ОАО «РЖД». В 2006 году этот показатель увеличился до 3494 вагона.
С целью оптимизации перевозок в 2007 году «Фосагро-Транс» планирует продолжить замену арендованных вагонов на собственные.